Vicissitudes et construction d'un club stable - 1940 / 1968
En 1948, année du 20ème anniversaire, l’équipe accède en division 1 en enlevant le titre de Champion du Haut-Rhin de Division 2, manquant de peu le titre de Champion d’Alsace.
Les année d’après guerre sont également marquées par l’organisation de grandes rencontres de propagande, notamment contre les réserves professionnelles du FC Sochaux et du Racing Club de Strasbourg, qui drainent la foule des grands jours. Le club se maintient en Division 1 jusqu’en 1956 et se retrouve alors relégué en Division 2. La remontée en Division 1 survient en 1961.
En 1968, ce sont les festivités du 40ème anniversaire et en guise d’apothéose, un match de championnat de France Amateur (CFA), entre Sochaux alors leader et l’AS Mulhouse second est organisé, devant plus de 1000 spectateurs.